Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms