Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H2BFSP57053 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H2BFSP57053 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H2BFSP57053 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H2BFSP57053 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H2BFSP57053 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H2BFSP57053 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
H2BFSP57053 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2BFSP57053 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
H2BFSP57053 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2BFSP57053 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2BFSP57053 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2BFSP57053 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2BFSP57053 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
H2BFSP57053 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2BFSP57053 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2BFSP57053 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
H2BFSP57053 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2BFSP57053 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2BFSP57053 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2BFSP57053 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H2BFSP57053 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H2BFSP57053 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2BFSP57053 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2BFSP57053 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2BFSP57053 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2BFSP57053 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2BFSP57053 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2BFSP57053 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2BFSP57053 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2BFSP57053 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2BFSP57053 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2BFSP57053 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2BFSP57053 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2BFSP57053 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2BFSP57053 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2BFSP57053 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2BFSP57053 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2BFSP57053 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2BFSP57053 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2BFSP57053 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2BFSP57053 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2BFSP57053 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2BFSP57053 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2BFSP57053 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2BFSP57053 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2BFSP57053 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2BFSP57053 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2BFSP57053 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2BFSP57053 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2BFSP57053 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2BFSP57053 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2BFSP57053 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2BFSP57053 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2BFSP57053 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2BFSP57053 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2BFSP57053 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2BFSP57053 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2BFSP57053 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2BFSP57053 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2BFSP57053 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2BFSP57053 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2BFSP57053 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2BFSP57053 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2BFSP57053 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2BFSP57053 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2BFSP57053 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2BFSP57053 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2BFSP57053 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2BFSP57053 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2BFSP57053 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2BFSP57053 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2BFSP57053 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2BFSP57053 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2BFSP57053 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2BFSP57053 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2BFSP57053 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2BFSP57053 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2BFSP57053 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms