RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550703.6

TCTN1-223, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2 BASIC

Gene TCTN1, Length 2,149 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-223	ENST00000550703	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.65	■■■■■ 4.26
TCTN1-223	ENST00000550703	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.99	■■■■□ 3.35
TCTN1-223	ENST00000550703	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.06	■■■■□ 3.2
TCTN1-223	ENST00000550703	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.55	■■■■□ 3.12
TCTN1-223	ENST00000550703	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.49	■■■■□ 3.11
TCTN1-223	ENST00000550703	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.3	■■■■□ 3.08
TCTN1-223	ENST00000550703	ABCC9	O60706	1549 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TCTN1-223	ENST00000550703	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TCTN1-223	ENST00000550703	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
TCTN1-223	ENST00000550703	NACAD	O15069	1562 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TCTN1-223	ENST00000550703	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TCTN1-223	ENST00000550703	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TCTN1-223	ENST00000550703	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TCTN1-223	ENST00000550703	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TCTN1-223	ENST00000550703	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TCTN1-223	ENST00000550703	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCTN1-223	ENST00000550703	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TCTN1-223	ENST00000550703	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TCTN1-223	ENST00000550703	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73
TCTN1-223	ENST00000550703	WIZ	O95785	1651 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TCTN1-223	ENST00000550703	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TCTN1-223	ENST00000550703	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TCTN1-223	ENST00000550703	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
TCTN1-223	ENST00000550703	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TCTN1-223	ENST00000550703	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TCTN1-223	ENST00000550703	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TCTN1-223	ENST00000550703	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TCTN1-223	ENST00000550703	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TCTN1-223	ENST00000550703	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
TCTN1-223	ENST00000550703	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
TCTN1-223	ENST00000550703	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TCTN1-223	ENST00000550703	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TCTN1-223	ENST00000550703	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
TCTN1-223	ENST00000550703	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.9	■■■□□ 2.54
TCTN1-223	ENST00000550703	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.85	■■■□□ 2.53
TCTN1-223	ENST00000550703	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.6	■■■□□ 2.49
TCTN1-223	ENST00000550703	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.58	■■■□□ 2.49
TCTN1-223	ENST00000550703	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.56	■■■□□ 2.48
TCTN1-223	ENST00000550703	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.5	■■■□□ 2.47
TCTN1-223	ENST00000550703	SOGA1	O94964	1423 aa		30.47	■■■□□ 2.47
TCTN1-223	ENST00000550703	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.37	■■■□□ 2.45
TCTN1-223	ENST00000550703	CFTR	P13569	1480 aa		30.37	■■■□□ 2.45
TCTN1-223	ENST00000550703	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.26	■■■□□ 2.43
TCTN1-223	ENST00000550703	EEA1	Q15075	1411 aa		30.26	■■■□□ 2.43
TCTN1-223	ENST00000550703	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.23	■■■□□ 2.43
TCTN1-223	ENST00000550703	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		30.22	■■■□□ 2.43
TCTN1-223	ENST00000550703	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.21	■■■□□ 2.43
TCTN1-223	ENST00000550703	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.18	■■■□□ 2.42
TCTN1-223	ENST00000550703	CUX1	P39880	1505 aa		30.13	■■■□□ 2.41
TCTN1-223	ENST00000550703	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		30.13	■■■□□ 2.41
TCTN1-223	ENST00000550703	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TCTN1-223	ENST00000550703	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.95	■■■□□ 2.39
TCTN1-223	ENST00000550703	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
TCTN1-223	ENST00000550703	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TCTN1-223	ENST00000550703	KIF21B	O75037	1637 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TCTN1-223	ENST00000550703	NES	P48681	1621 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TCTN1-223	ENST00000550703	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TCTN1-223	ENST00000550703	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.89	■■■□□ 2.38
TCTN1-223	ENST00000550703	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
TCTN1-223	ENST00000550703	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.87	■■■□□ 2.37
TCTN1-223	ENST00000550703	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.79	■■■□□ 2.36
TCTN1-223	ENST00000550703	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.75	■■■□□ 2.35
TCTN1-223	ENST00000550703	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.73	■■■□□ 2.35
TCTN1-223	ENST00000550703	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.71	■■■□□ 2.35
TCTN1-223	ENST00000550703	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
TCTN1-223	ENST00000550703	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TCTN1-223	ENST00000550703	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.63	■■■□□ 2.33
TCTN1-223	ENST00000550703	CUX2	O14529	1486 aa		29.61	■■■□□ 2.33
TCTN1-223	ENST00000550703	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.61	■■■□□ 2.33
TCTN1-223	ENST00000550703	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.6	■■■□□ 2.33
TCTN1-223	ENST00000550703	CLIP1	P30622	1438 aa		29.54	■■■□□ 2.32
TCTN1-223	ENST00000550703	HRC	P23327	699 aa		29.54	■■■□□ 2.32
TCTN1-223	ENST00000550703	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.52	■■■□□ 2.32
TCTN1-223	ENST00000550703	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
TCTN1-223	ENST00000550703	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.5	■■■□□ 2.31
TCTN1-223	ENST00000550703	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TCTN1-223	ENST00000550703	IGF1R	P08069	1367 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TCTN1-223	ENST00000550703	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TCTN1-223	ENST00000550703	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
TCTN1-223	ENST00000550703	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TCTN1-223	ENST00000550703	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TCTN1-223	ENST00000550703	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
TCTN1-223	ENST00000550703	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TCTN1-223	ENST00000550703	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TCTN1-223	ENST00000550703	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TCTN1-223	ENST00000550703	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TCTN1-223	ENST00000550703	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TCTN1-223	ENST00000550703	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TCTN1-223	ENST00000550703	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCTN1-223	ENST00000550703	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TCTN1-223	ENST00000550703	CUL7	Q14999	1698 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCTN1-223	ENST00000550703	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCTN1-223	ENST00000550703	APLP2	Q06481	763 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCTN1-223	ENST00000550703	WDR62	O43379	1518 aa		28.95	■■■□□ 2.23
TCTN1-223	ENST00000550703	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCTN1-223	ENST00000550703	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22
TCTN1-223	ENST00000550703	ERCC6	Q03468	1493 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCTN1-223	ENST00000550703	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCTN1-223	ENST00000550703	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TCTN1-223	ENST00000550703	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.84	■■■□□ 2.21

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