Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms