Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 21.75□□□□□ -2.139e-7■■■■■ 33.5
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SF3B4Q15427 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-8■■■■■ 33.5
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SF3B4Q15427 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 33.5
SF3B4Q15427 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 33.5
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SF3B4Q15427 PSMC6-210ENST00000555339 583 ntTSL 53.97□□□□□ -1.771e-8■■■■■ 33.4
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SF3B4Q15427 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 514.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 514.18□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 547 ntTSL 511.41□□□□□ -0.584e-23■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 AL450384.2-201ENST00000425669 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.284e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 RPL7-208ENST00000487500 534 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.64e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 OSBPL9-221ENST00000531819 4520 ntTSL 25.07□□□□□ -1.65e-12■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ERO1A-209ENST00000556769 934 ntTSL 54.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 ERO1A-208ENST00000556358 951 ntTSL 24.82□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 TCERG1-216ENST00000549332 3518 ntTSL 59.91□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 HSF1-206ENST00000528988 775 ntTSL 323.23■■□□□ 1.316e-12■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 HSF1-207ENST00000529630 646 ntTSL 220.2■□□□□ 0.826e-12■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 WDR59-205ENST00000562371 562 ntTSL 28.94□□□□□ -0.983e-10■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 33.4
SF3B4Q15427 SIRT7-202ENST00000536038 1883 ntTSL 219.46■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 33.4
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