Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 EPB41L2-223ENST00000530148 664 ntTSL 49.57□□□□□ -0.881e-18■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 NEDD4L-230ENST00000590638 862 ntTSL 29.4□□□□□ -0.98e-8■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 ESYT1-209ENST00000551112 548 ntTSL 39.04□□□□□ -0.968e-8■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.978e-8■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 58.45□□□□□ -1.061e-18■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 57.36□□□□□ -1.231e-18■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 57.25□□□□□ -1.251e-18■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 NEDD4L-213ENST00000585970 487 ntTSL 33.15□□□□□ -1.918e-8■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 DNAJA3-210ENST00000574895 558 ntTSL 428.06■■■□□ 2.081e-6■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 DNAJA3-204ENST00000570857 554 ntTSL 326.85■■□□□ 1.891e-6■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 DNAJA3-214ENST00000577083 3351 ntTSL 511.25□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 320.06■□□□□ 0.88e-9■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.177e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.027e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.847e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.237e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 A1CF-210ENST00000493415 926 ntTSL 57□□□□□ -1.297e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.387e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.417e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 HMGCS1-207ENST00000514610 555 ntTSL 25.61□□□□□ -1.511e-12■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 TKT-209ENST00000466765 693 ntTSL 221.77■■□□□ 1.086e-14■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.169e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.199e-7■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 PHGDH-219ENST00000641513 735 nt10.9□□□□□ -0.661e-8■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 DDX17-208ENST00000477112 654 ntTSL 23.2□□□□□ -1.91e-9■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.412e-6■■□□□ 11.6
G3BP1Q13283 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 325.75■■□□□ 1.712e-6■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 IPO4-219ENST00000561379 624 ntTSL 418.3■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 CHD4-207ENST00000537634 691 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 11.6
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G3BP1Q13283 IQGAP2-207ENST00000504558 447 ntTSL 25.25□□□□□ -1.576e-15■■□□□ 11.5
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G3BP1Q13283 ADH6-205ENST00000507484 991 ntTSL 216.71■□□□□ 0.275e-7■■□□□ 11.5
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G3BP1Q13283 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.955e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.395e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME2-208ENST00000559359 484 ntTSL 212.88□□□□□ -0.357e-7■■□□□ 11.5
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G3BP1Q13283 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.251e-6■■□□□ 11.5
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G3BP1Q13283 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.193e-6■■□□□ 11.5
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G3BP1Q13283 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.133e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.083e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RBMS1-214ENST00000491781 1533 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.933e-8■■□□□ 11.5
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G3BP1Q13283 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.853e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.823e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.783e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.093e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.263e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 25.87□□□□□ -1.478e-10■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.493e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.813e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.062e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 GLRX3-203ENST00000481034 1921 ntTSL 1 (best)26.06■■□□□ 1.762e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RNF213-216ENST00000573548 616 ntTSL 216.5■□□□□ 0.233e-9■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 AKAP1-209ENST00000572560 442 ntTSL 319.38■□□□□ 0.694e-9■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.492e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 220.87■□□□□ 0.932e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 ACTN1-208ENST00000553370 605 ntTSL 312.21□□□□□ -0.454e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 ACTN1-212ENST00000554158 571 ntTSL 410.02□□□□□ -0.814e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 313.1□□□□□ -0.317e-10■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 LMNA-222ENST00000508500 848 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.87e-9■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.678e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-210ENST00000537947 1100 ntTSL 331.4■■■□□ 2.628e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.618e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)29.67■■■□□ 2.348e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MED24-208ENST00000479829 733 ntTSL 529.08■■■□□ 2.258e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PUF60-222ENST00000533362 616 ntTSL 527.83■■■□□ 2.058e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.948e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.98e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.98e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-204ENST00000543428 956 ntTSL 226.55■■□□□ 1.848e-6■■□□□ 11.5
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