Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms