Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
RPS28P62857 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RPS28P62857 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms