Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms