Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYVE1Q9Y5Y7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYVE1Q9Y5Y7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYVE1Q9Y5Y7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LYVE1Q9Y5Y7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms