Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B6Q9Y3B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3B6Q9Y3B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3B6Q9Y3B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B6Q9Y3B4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms