Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMS3Q9UJD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIMS3Q9UJD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIMS3Q9UJD0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIMS3Q9UJD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIMS3Q9UJD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms