Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NANOGQ9H9S0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGQ9H9S0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NANOGQ9H9S0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGQ9H9S0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms