Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG5Q9H1Y0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG5Q9H1Y0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG5Q9H1Y0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG5Q9H1Y0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms