Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA4Q9BXL8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA4Q9BXL8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDCA4Q9BXL8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA4Q9BXL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA4Q9BXL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms