Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM4Q9BWF3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBM4Q9BWF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBM4Q9BWF3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBM4Q9BWF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBM4Q9BWF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms