Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNFT2Q96EX2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNFT2Q96EX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNFT2Q96EX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNFT2Q96EX2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms