Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RP9Q8TA86 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RP9Q8TA86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RP9Q8TA86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RP9Q8TA86 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RP9Q8TA86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RP9Q8TA86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RP9Q8TA86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RP9Q8TA86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RP9Q8TA86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms