Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM229BQ8NBD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM229BQ8NBD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM229BQ8NBD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM229BQ8NBD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms