Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3F8

MICALL1, MICAL-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICALL1Q8N3F8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MICALL1Q8N3F8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MICALL1Q8N3F8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MICALL1Q8N3F8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MICALL1Q8N3F8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MICALL1Q8N3F8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MICALL1Q8N3F8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MICALL1Q8N3F8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MICALL1Q8N3F8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MICALL1Q8N3F8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MICALL1Q8N3F8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MICALL1Q8N3F8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICALL1Q8N3F8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms