Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARCQ7LC44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARCQ7LC44 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARCQ7LC44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARCQ7LC44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARCQ7LC44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARCQ7LC44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARCQ7LC44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARCQ7LC44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARCQ7LC44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARCQ7LC44 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms