Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 CCS-205ENST00000530384 1196 ntTSL 520.03■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CCS-203ENST00000526058 593 ntTSL 419.98■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.785e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 519.89■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CCS-204ENST00000526066 872 ntTSL 219.88■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 419.82■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 519.82■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-204ENST00000553361 746 ntTSL 519.55■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-207ENST00000477451 789 ntTSL 519.43■□□□□ 0.75e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 419.33■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FBXO22-209ENST00000569749 1496 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 319.24■□□□□ 0.675e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-215ENST00000573927 778 ntTSL 319.13■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 519.1■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC026412.1-204ENST00000507505 1009 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 318.88■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 518.88■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.65e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FBXO22-207ENST00000569022 2164 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-218ENST00000557439 2599 ntTSL 518.73■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.595e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 518.67■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TPRN-201ENST00000333046 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.53■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 518.48■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-202ENST00000469235 678 ntTSL 318.47■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-212ENST00000497165 675 ntTSL 318.25■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 218.25■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 318.12■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 418.07■□□□□ 0.485e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 417.89■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CCS-206ENST00000530961 1214 ntTSL 517.75■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-221ENST00000575750 584 ntTSL 417.6■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-210ENST00000482962 597 ntTSL 317.47■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 NOC4L-204ENST00000541954 1009 ntTSL 517.43■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 217.38■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 C7orf50-206ENST00000465681 2621 ntTSL 1 (best)17.34■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGAP3-210ENST00000473140 624 ntTSL 417.28■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 217.15■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 216.97■□□□□ 0.315e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 416.91■□□□□ 0.35e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 316.86■□□□□ 0.295e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-203ENST00000553332 560 ntTSL 316.78■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 516.68■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 316.5■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 516.35■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 316.25■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DTX2-207ENST00000435251 547 ntTSL 516.19■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 416.1■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.89■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.78■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-207ENST00000479985 551 ntTSL 415.77■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-212ENST00000555231 582 ntTSL 315.65■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 415.63■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-205ENST00000473546 291 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 215.52■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 315.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 315.47■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGAP3-223ENST00000492234 560 ntTSL 415.19■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.08■□□□□ 05e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 MXD4-203ENST00000513372 4228 ntTSL 215.02□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-206ENST00000554170 572 ntTSL 414.9□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 45.5
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 27.3 ms