Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNW5

GDPGP1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1Q6ZNW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPGP1Q6ZNW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPGP1Q6ZNW5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPGP1Q6ZNW5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDPGP1Q6ZNW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDPGP1Q6ZNW5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms