Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGNBP1Q5YKI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms