Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP6Q5VW22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP6Q5VW22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP6Q5VW22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP6Q5VW22 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms