Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM27D1Q5T7N8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM27D1Q5T7N8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM27D1Q5T7N8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27D1Q5T7N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27D1Q5T7N8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms