Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSD17B12Q53GQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSD17B12Q53GQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSD17B12Q53GQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSD17B12Q53GQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSD17B12Q53GQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms