Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAPC1Q16533 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAPC1Q16533 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC1Q16533 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAPC1Q16533 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC1Q16533 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms