Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP6AP1Q15904 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6AP1Q15904 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6AP1Q15904 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms