Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAPTM4AQ15012 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAPTM4AQ15012 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAPTM4AQ15012 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAPTM4AQ15012 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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