Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms