Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF3Q14653 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF3Q14653 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF3Q14653 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF3Q14653 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF3Q14653 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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