Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A2Q01362 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A2Q01362 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A2Q01362 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A2Q01362 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A2Q01362 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms