Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5Q00535 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5Q00535 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK5Q00535 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5Q00535 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms