Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX16P57768 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX16P57768 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX16P57768 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX16P57768 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX16P57768 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX16P57768 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX16P57768 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX16P57768 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX16P57768 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX16P57768 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX16P57768 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX16P57768 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX16P57768 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX16P57768 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX16P57768 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX16P57768 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX16P57768 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX16P57768 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX16P57768 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX16P57768 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX16P57768 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX16P57768 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX16P57768 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX16P57768 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX16P57768 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX16P57768 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX16P57768 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX16P57768 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX16P57768 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX16P57768 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX16P57768 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX16P57768 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX16P57768 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX16P57768 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX16P57768 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX16P57768 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX16P57768 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX16P57768 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX16P57768 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX16P57768 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX16P57768 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX16P57768 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX16P57768 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX16P57768 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX16P57768 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX16P57768 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX16P57768 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX16P57768 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX16P57768 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX16P57768 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX16P57768 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX16P57768 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX16P57768 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX16P57768 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX16P57768 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX16P57768 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX16P57768 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX16P57768 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX16P57768 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX16P57768 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX16P57768 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX16P57768 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX16P57768 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX16P57768 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX16P57768 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX16P57768 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX16P57768 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX16P57768 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX16P57768 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX16P57768 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX16P57768 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX16P57768 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX16P57768 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX16P57768 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX16P57768 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX16P57768 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX16P57768 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX16P57768 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX16P57768 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX16P57768 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX16P57768 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX16P57768 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX16P57768 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX16P57768 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX16P57768 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX16P57768 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX16P57768 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX16P57768 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX16P57768 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX16P57768 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX16P57768 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX16P57768 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX16P57768 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX16P57768 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX16P57768 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX16P57768 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX16P57768 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX16P57768 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX16P57768 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms