Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2KP53803 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2KP53803 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms