Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGA2P52926 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGA2P52926 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMGA2P52926 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGA2P52926 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms