Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGA2P52926 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HMGA2P52926 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGA2P52926 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HMGA2P52926 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HMGA2P52926 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGA2P52926 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMGA2P52926 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGA2P52926 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGA2P52926 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMGA2P52926 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGA2P52926 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMGA2P52926 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGA2P52926 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGA2P52926 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGA2P52926 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMGA2P52926 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGA2P52926 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HMGA2P52926 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HMGA2P52926 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HMGA2P52926 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HMGA2P52926 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGA2P52926 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMGA2P52926 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGA2P52926 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HMGA2P52926 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGA2P52926 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGA2P52926 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGA2P52926 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMGA2P52926 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HMGA2P52926 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HMGA2P52926 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGA2P52926 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGA2P52926 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGA2P52926 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGA2P52926 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGA2P52926 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGA2P52926 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGA2P52926 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA2P52926 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGA2P52926 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HMGA2P52926 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGA2P52926 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGA2P52926 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGA2P52926 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGA2P52926 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HMGA2P52926 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGA2P52926 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGA2P52926 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGA2P52926 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGA2P52926 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGA2P52926 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGA2P52926 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGA2P52926 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGA2P52926 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGA2P52926 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGA2P52926 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGA2P52926 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGA2P52926 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGA2P52926 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGA2P52926 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGA2P52926 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGA2P52926 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGA2P52926 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGA2P52926 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGA2P52926 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGA2P52926 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMGA2P52926 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMGA2P52926 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGA2P52926 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGA2P52926 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGA2P52926 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGA2P52926 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGA2P52926 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGA2P52926 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGA2P52926 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMGA2P52926 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMGA2P52926 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGA2P52926 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGA2P52926 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGA2P52926 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HMGA2P52926 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGA2P52926 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGA2P52926 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGA2P52926 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGA2P52926 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGA2P52926 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGA2P52926 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGA2P52926 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGA2P52926 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGA2P52926 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGA2P52926 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms