Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LYL1P12980 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYL1P12980 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYL1P12980 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYL1P12980 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LYL1P12980 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYL1P12980 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYL1P12980 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYL1P12980 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYL1P12980 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYL1P12980 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYL1P12980 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYL1P12980 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYL1P12980 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYL1P12980 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYL1P12980 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYL1P12980 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYL1P12980 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYL1P12980 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYL1P12980 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYL1P12980 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYL1P12980 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LYL1P12980 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYL1P12980 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYL1P12980 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYL1P12980 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYL1P12980 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYL1P12980 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYL1P12980 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYL1P12980 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LYL1P12980 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYL1P12980 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYL1P12980 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYL1P12980 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYL1P12980 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYL1P12980 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYL1P12980 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYL1P12980 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYL1P12980 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYL1P12980 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYL1P12980 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYL1P12980 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYL1P12980 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYL1P12980 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYL1P12980 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYL1P12980 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYL1P12980 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYL1P12980 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYL1P12980 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYL1P12980 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYL1P12980 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYL1P12980 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYL1P12980 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYL1P12980 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYL1P12980 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYL1P12980 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYL1P12980 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYL1P12980 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LYL1P12980 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYL1P12980 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYL1P12980 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYL1P12980 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYL1P12980 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYL1P12980 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYL1P12980 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYL1P12980 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYL1P12980 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYL1P12980 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYL1P12980 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYL1P12980 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYL1P12980 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYL1P12980 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYL1P12980 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYL1P12980 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYL1P12980 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYL1P12980 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYL1P12980 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYL1P12980 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYL1P12980 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYL1P12980 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYL1P12980 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYL1P12980 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYL1P12980 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYL1P12980 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYL1P12980 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYL1P12980 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYL1P12980 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LYL1P12980 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYL1P12980 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYL1P12980 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYL1P12980 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LYL1P12980 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LYL1P12980 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms