Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHACTR2O75167 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHACTR2O75167 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHACTR2O75167 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHACTR2O75167 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR2O75167 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms