Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDUFB5O43674 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDUFB5O43674 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFB5O43674 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFB5O43674 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFB5O43674 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms