Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC26A4O43511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC26A4O43511 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC26A4O43511 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC26A4O43511 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC26A4O43511 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms