Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 36.2
PRPF4O43172 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.841e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.347e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 313.11□□□□□ -0.317e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.727e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.827e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 28.13□□□□□ -1.117e-11■■■■■ 36.1
PRPF4O43172 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 213.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 513.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 510.25□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 210.1□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-210ENST00000590107 1616 ntTSL 521.74■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-202ENST00000383376 1575 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-205ENST00000588752 651 ntTSL 319.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-211ENST00000590138 895 ntTSL 518.97■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 36
PRPF4O43172 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 418.59■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 36
PRPF4O43172 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 36
PRPF4O43172 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 36
PRPF4O43172 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 36
PRPF4O43172 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.048e-7■■■■■ 36
PRPF4O43172 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.567e-8■■■■■ 35.9
PRPF4O43172 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 35.9
PRPF4O43172 TAB2-206ENST00000606202 648 ntTSL 44.14□□□□□ -1.757e-8■■■■■ 35.9
PRPF4O43172 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.593e-12■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 FUS-207ENST00000487974 643 ntTSL 215.38■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-203ENST00000547247 1584 ntTSL 1 (best)22.22■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 322.06■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-204ENST00000547637 587 ntTSL 222.06■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 520.5■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 SMARCD1-211ENST00000551497 536 ntTSL 414.34□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 35.8
PRPF4O43172 TSPAN9-207ENST00000539631 584 ntTSL 312.07□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 MTF2-207ENST00000474314 816 ntTSL 514.4□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 MTF2-211ENST00000494963 885 ntTSL 510.41□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 35.7
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PRPF4O43172 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 MTF2-205ENST00000471953 1937 ntTSL 26.88□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 MTF2-206ENST00000473430 760 ntTSL 55.25□□□□□ -1.571e-8■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 ABCA2-207ENST00000437791 697 ntTSL 516.92■□□□□ 0.36e-13■■■■■ 35.7
PRPF4O43172 PPIG-203ENST00000414307 1062 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.095e-11■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 PPIG-205ENST00000418888 525 ntTSL 413.02□□□□□ -0.335e-11■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-207ENST00000527468 571 ntTSL 218.95■□□□□ 0.621e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-216ENST00000532373 620 ntTSL 315.59■□□□□ 0.091e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-210ENST00000528357 500 ntTSL 414.85□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-205ENST00000526982 965 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-213ENST00000530889 563 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 35.6
PRPF4O43172 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.291e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 SLC19A1-210ENST00000486303 708 ntTSL 219.21■□□□□ 0.671e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 319.1■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 217.1■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 316.78■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 216.28■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 MEF2A-211ENST00000559903 574 ntTSL 320.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 35.5
PRPF4O43172 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 RAVER1-203ENST00000591969 742 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-10■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-10■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-9■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 212.01□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 35.4
PRPF4O43172 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 35.3
PRPF4O43172 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.474e-10■■■■■ 35.3
PRPF4O43172 RABEP1-207ENST00000575991 551 ntTSL 417.78■□□□□ 0.444e-10■■■■■ 35.3
PRPF4O43172 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 35.3
PRPF4O43172 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 46.96□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-208ENST00000558856 574 ntTSL 424.4■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-210ENST00000559036 685 ntTSL 224.4■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-209ENST00000558983 847 ntTSL 324.34■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-212ENST00000560493 732 ntTSL 422.54■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-206ENST00000558049 565 ntTSL 411.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -11e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 35.2
PRPF4O43172 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 525.92■■□□□ 1.746e-13■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.424e-8■■■■■ 35.1
PRPF4O43172 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-8■■■■■ 35.1
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