RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583378.5

NFE2L1-218, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NFE2L1, Length 2,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L1-218ENST00000583378 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.39■■■□□ 2.46
NFE2L1-218ENST00000583378 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.17■■□□□ 1.78
NFE2L1-218ENST00000583378 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
NFE2L1-218ENST00000583378 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.14■■□□□ 1.61
NFE2L1-218ENST00000583378 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.13■■□□□ 1.61
NFE2L1-218ENST00000583378 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.01■■□□□ 1.59
NFE2L1-218ENST00000583378 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.66■■□□□ 1.54
NFE2L1-218ENST00000583378 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NFE2L1-218ENST00000583378 ABCC9O60706 1549 aa24.37■■□□□ 1.49
NFE2L1-218ENST00000583378 NACADO15069 1562 aa24.33■■□□□ 1.49
NFE2L1-218ENST00000583378 SCRIBQ14160 1630 aa24.14■■□□□ 1.46
NFE2L1-218ENST00000583378 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.97■■□□□ 1.43
NFE2L1-218ENST00000583378 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NFE2L1-218ENST00000583378 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.75■■□□□ 1.39
NFE2L1-218ENST00000583378 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.59■■□□□ 1.37
NFE2L1-218ENST00000583378 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.49■■□□□ 1.35
NFE2L1-218ENST00000583378 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.45■■□□□ 1.34
NFE2L1-218ENST00000583378 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NFE2L1-218ENST00000583378 WIZO95785 1651 aa23.29■■□□□ 1.32
NFE2L1-218ENST00000583378 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.27■■□□□ 1.32
NFE2L1-218ENST00000583378 SMARCA4P51532 1647 aa23.2■■□□□ 1.31
NFE2L1-218ENST00000583378 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.31e-8■□□□□ 9.6
NFE2L1-218ENST00000583378 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NFE2L1-218ENST00000583378 TRIM41Q8WV44 630 aa23.02■■□□□ 1.28
NFE2L1-218ENST00000583378 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.94■■□□□ 1.26
NFE2L1-218ENST00000583378 HRCP23327 699 aa22.93■■□□□ 1.26
NFE2L1-218ENST00000583378 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.9■■□□□ 1.26
NFE2L1-218ENST00000583378 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.88■■□□□ 1.25
NFE2L1-218ENST00000583378 SMARCA2P51531 1590 aa22.87■■□□□ 1.25
NFE2L1-218ENST00000583378 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NFE2L1-218ENST00000583378 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.76■■□□□ 1.23
NFE2L1-218ENST00000583378 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.71■■□□□ 1.23
NFE2L1-218ENST00000583378 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NFE2L1-218ENST00000583378 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
NFE2L1-218ENST00000583378 ABCC8Q09428 1581 aa22.52■■□□□ 1.2
NFE2L1-218ENST00000583378 NCAPD3P42695 1498 aa22.51■■□□□ 1.19
NFE2L1-218ENST00000583378 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NFE2L1-218ENST00000583378 HMGXB3Q12766 1538 aa22.44■■□□□ 1.18
NFE2L1-218ENST00000583378 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
NFE2L1-218ENST00000583378 EEA1Q15075 1411 aa22.32■■□□□ 1.16
NFE2L1-218ENST00000583378 SOGA1O94964 1423 aa22.27■■□□□ 1.16
NFE2L1-218ENST00000583378 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.22■■□□□ 1.15
NFE2L1-218ENST00000583378 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.21■■□□□ 1.15
NFE2L1-218ENST00000583378 SYNJ1O43426 1573 aa22.2■■□□□ 1.14
NFE2L1-218ENST00000583378 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NFE2L1-218ENST00000583378 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.15■■□□□ 1.14
NFE2L1-218ENST00000583378 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NFE2L1-218ENST00000583378 CFTRP13569 1480 aa22.13■■□□□ 1.13
NFE2L1-218ENST00000583378 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.1■■□□□ 1.13
NFE2L1-218ENST00000583378 TOP2BQ02880 1626 aa22.09■■□□□ 1.13
NFE2L1-218ENST00000583378 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.05■■□□□ 1.12
NFE2L1-218ENST00000583378 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.02■■□□□ 1.12
NFE2L1-218ENST00000583378 GOLGA3Q08378 1498 aa22■■□□□ 1.11
NFE2L1-218ENST00000583378 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2L1-218ENST00000583378 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.96■■□□□ 1.11
NFE2L1-218ENST00000583378 CEP162Q5TB80 1403 aa21.96■■□□□ 1.11
NFE2L1-218ENST00000583378 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NFE2L1-218ENST00000583378 KIF21BO75037 1637 aa21.94■■□□□ 1.1
NFE2L1-218ENST00000583378 CUX1P39880 1505 aa21.92■■□□□ 1.1
NFE2L1-218ENST00000583378 PRDM2Q13029 1718 aa21.89■■□□□ 1.09
NFE2L1-218ENST00000583378 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.77■■□□□ 1.07
NFE2L1-218ENST00000583378 KIF27Q86VH2 1401 aa21.77■■□□□ 1.07
NFE2L1-218ENST00000583378 PRXQ9BXM0 1461 aa21.76■■□□□ 1.07
NFE2L1-218ENST00000583378 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.72■■□□□ 1.07
NFE2L1-218ENST00000583378 CLIP1P30622 1438 aa21.69■■□□□ 1.06
NFE2L1-218ENST00000583378 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.68■■□□□ 1.06
NFE2L1-218ENST00000583378 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.6■■□□□ 1.05
NFE2L1-218ENST00000583378 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.59■■□□□ 1.05
NFE2L1-218ENST00000583378 IGF1RP08069 1367 aa21.58■■□□□ 1.05
NFE2L1-218ENST00000583378 CUX2O14529 1486 aa21.57■■□□□ 1.04
NFE2L1-218ENST00000583378 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.57■■□□□ 1.04
NFE2L1-218ENST00000583378 NESP48681 1621 aa21.56■■□□□ 1.04
NFE2L1-218ENST00000583378 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.54■■□□□ 1.04
NFE2L1-218ENST00000583378 TOPBP1Q92547 1522 aa21.5■■□□□ 1.03
NFE2L1-218ENST00000583378 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L1-218ENST00000583378 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L1-218ENST00000583378 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.45■■□□□ 1.02
NFE2L1-218ENST00000583378 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.44■■□□□ 1.02
NFE2L1-218ENST00000583378 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NFE2L1-218ENST00000583378 APLP2Q06481 763 aa21.41■■□□□ 1.02
NFE2L1-218ENST00000583378 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NFE2L1-218ENST00000583378 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NFE2L1-218ENST00000583378 ARAP1Q96P48 1450 aa21.39■■□□□ 1.01
NFE2L1-218ENST00000583378 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE2L1-218ENST00000583378 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NFE2L1-218ENST00000583378 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NFE2L1-218ENST00000583378 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NFE2L1-218ENST00000583378 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.31■■□□□ 1
NFE2L1-218ENST00000583378 WDR97A6NE52 1622 aa21.23■□□□□ 0.99
NFE2L1-218ENST00000583378 CUL7Q14999 1698 aa21.23■□□□□ 0.99
NFE2L1-218ENST00000583378 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.23■□□□□ 0.99
NFE2L1-218ENST00000583378 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NFE2L1-218ENST00000583378 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.16■□□□□ 0.98
NFE2L1-218ENST00000583378 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.16■□□□□ 0.98
NFE2L1-218ENST00000583378 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
NFE2L1-218ENST00000583378 MAP3K1Q13233 1512 aa21.13■□□□□ 0.97
NFE2L1-218ENST00000583378 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NFE2L1-218ENST00000583378 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.11■□□□□ 0.97
NFE2L1-218ENST00000583378 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.09■□□□□ 0.97
NFE2L1-218ENST00000583378 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms