Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A1W2PPK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PPK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPK0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms