Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms