Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ANKRD27Q96NW4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ANKRD27Q96NW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms