Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX29P2Q8IUI4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX29P2Q8IUI4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms