RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539736.5

C12orf43-208, Transcript of chromosome 12 open reading frame 43, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C12orf43, Length 1,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43-208ENST00000539736 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.38■■■■■ 5.66
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C12orf43-208ENST00000539736 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
C12orf43-208ENST00000539736 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.76■■■■■ 4.28
C12orf43-208ENST00000539736 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.69■■■■■ 4.26
C12orf43-208ENST00000539736 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.64■■■■■ 4.26
C12orf43-208ENST00000539736 NACADO15069 1562 aa41.57■■■■■ 4.25
C12orf43-208ENST00000539736 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.39■■■■■ 4.22
C12orf43-208ENST00000539736 SCRIBQ14160 1630 aa40.56■■■■■ 4.08
C12orf43-208ENST00000539736 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.45■■■■■ 4.07
C12orf43-208ENST00000539736 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.25■■■■■ 4.03
C12orf43-208ENST00000539736 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.11■■■■■ 4.01
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C12orf43-208ENST00000539736 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.83■■■■□ 3.81
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C12orf43-208ENST00000539736 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.6■■■■□ 3.77
C12orf43-208ENST00000539736 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.53■■■■□ 3.76
C12orf43-208ENST00000539736 SMARCA2P51531 1590 aa38.48■■■■□ 3.75
C12orf43-208ENST00000539736 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.48■■■■□ 3.75
C12orf43-208ENST00000539736 WIZO95785 1651 aa38.44■■■■□ 3.74
C12orf43-208ENST00000539736 NCAPD3P42695 1498 aa38.35■■■■□ 3.73
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C12orf43-208ENST00000539736 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.28■■■■□ 3.56
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C12orf43-208ENST00000539736 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.19■■■■□ 3.54
C12orf43-208ENST00000539736 NESP48681 1621 aa37.12■■■■□ 3.53
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C12orf43-208ENST00000539736 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.98■■■■□ 3.51
C12orf43-208ENST00000539736 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.92■■■■□ 3.5
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C12orf43-208ENST00000539736 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.7■■■■□ 3.47
C12orf43-208ENST00000539736 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.69■■■■□ 3.46
C12orf43-208ENST00000539736 ERCC6Q03468 1493 aa36.66■■■■□ 3.46
C12orf43-208ENST00000539736 ABCC8Q09428 1581 aa36.49■■■■□ 3.43
C12orf43-208ENST00000539736 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.47■■■■□ 3.43
C12orf43-208ENST00000539736 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.43
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C12orf43-208ENST00000539736 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
C12orf43-208ENST00000539736 CUX1P39880 1505 aa36.38■■■■□ 3.41
C12orf43-208ENST00000539736 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.37■■■■□ 3.41
C12orf43-208ENST00000539736 TOPBP1Q92547 1522 aa36.34■■■■□ 3.41
C12orf43-208ENST00000539736 WDR62O43379 1518 aa36.33■■■■□ 3.41
C12orf43-208ENST00000539736 SYNJ1O43426 1573 aa36.32■■■■□ 3.4
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C12orf43-208ENST00000539736 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.3■■■■□ 3.4
C12orf43-208ENST00000539736 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.29■■■■□ 3.4
C12orf43-208ENST00000539736 TRIM41Q8WV44 630 aa36.18■■■■□ 3.38
C12orf43-208ENST00000539736 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
C12orf43-208ENST00000539736 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
C12orf43-208ENST00000539736 CUX2O14529 1486 aa36■■■■□ 3.35
C12orf43-208ENST00000539736 SOGA1O94964 1423 aa35.96■■■■□ 3.35
C12orf43-208ENST00000539736 IFT140Q96RY7 1462 aa35.92■■■■□ 3.34
C12orf43-208ENST00000539736 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.9■■■■□ 3.34
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C12orf43-208ENST00000539736 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.83■■■■□ 3.33
C12orf43-208ENST00000539736 WDR97A6NE52 1622 aa35.78■■■■□ 3.32
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C12orf43-208ENST00000539736 KIF27Q86VH2 1401 aa35.65■■■■□ 3.3
C12orf43-208ENST00000539736 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
C12orf43-208ENST00000539736 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.6■■■■□ 3.29
C12orf43-208ENST00000539736 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.56■■■■□ 3.28
C12orf43-208ENST00000539736 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.56■■■■□ 3.28
C12orf43-208ENST00000539736 EEA1Q15075 1411 aa35.56■■■■□ 3.28
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C12orf43-208ENST00000539736 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
C12orf43-208ENST00000539736 PBRM1Q86U86 1689 aa35.41■■■■□ 3.26
C12orf43-208ENST00000539736 IGF1RP08069 1367 aa35.4■■■■□ 3.26
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C12orf43-208ENST00000539736 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
C12orf43-208ENST00000539736 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.26■■■■□ 3.23
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C12orf43-208ENST00000539736 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.2■■■■□ 3.23
C12orf43-208ENST00000539736 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.19■■■■□ 3.22
C12orf43-208ENST00000539736 ADAMTS12P58397 1594 aa35.19■■■■□ 3.22
C12orf43-208ENST00000539736 PRXQ9BXM0 1461 aa35.19■■■■□ 3.22
C12orf43-208ENST00000539736 SYNJ2O15056 1496 aa35.1■■■■□ 3.21
C12orf43-208ENST00000539736 KIF21BO75037 1637 aa35.1■■■■□ 3.21
C12orf43-208ENST00000539736 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
C12orf43-208ENST00000539736 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
C12orf43-208ENST00000539736 GRIN2AQ12879 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
C12orf43-208ENST00000539736 GOLGA3Q08378 1498 aa34.96■■■■□ 3.19
C12orf43-208ENST00000539736 FBLN2P98095 1184 aa34.94■■■■□ 3.18
C12orf43-208ENST00000539736 CHD1O14646 1710 aa34.93■■■■□ 3.18
C12orf43-208ENST00000539736 NUP160Q12769 1436 aa34.81■■■■□ 3.16
C12orf43-208ENST00000539736 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.8■■■■□ 3.16
C12orf43-208ENST00000539736 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.79■■■■□ 3.16
C12orf43-208ENST00000539736 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
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