Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.577e-7■□□□□ 11.1
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PUM1Q14671 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.139e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.149e-7■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.249e-7■□□□□ 11.1
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PUM1Q14671 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.686e-11■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.026e-11■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.226e-11■□□□□ 11.1
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PUM1Q14671 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.636e-11■□□□□ 11.1
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PUM1Q14671 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.336e-11■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.881e-6■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 11.1
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PUM1Q14671 CFL1-215ENST00000534784 737 ntTSL 319.25■□□□□ 0.672e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 517.51■□□□□ 0.398e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 216.26■□□□□ 0.198e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.038e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 513.63□□□□□ -0.238e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-209ENST00000506532 677 ntTSL 212.96□□□□□ -0.338e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.688e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.768e-13■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-11■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 RPS4X-204ENST00000486733 1820 ntTSL 57.47□□□□□ -1.211e-11■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.865e-9■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.655e-9■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 P4HB-220ENST00000575069 2453 ntTSL 214.05□□□□□ -0.165e-9■□□□□ 11.1
PUM1Q14671 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 220.27■□□□□ 0.832e-12■□□□□ 11
PUM1Q14671 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 214.6□□□□□ -0.072e-12■□□□□ 11
PUM1Q14671 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 220.53■□□□□ 0.881e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.791e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.95e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.85e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.185e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ANXA1-206ENST00000489109 749 ntTSL 26.79□□□□□ -1.329e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ANXA1-208ENST00000495713 905 ntTSL 25.5□□□□□ -1.539e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 ANXA1-204ENST00000456643 799 ntTSL 54.92□□□□□ -1.629e-8■□□□□ 11
PUM1Q14671 EIF3D-204ENST00000426531 710 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 11
PUM1Q14671 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.511e-11■□□□□ 11
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