RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508120.5

H2AFY-212, Transcript of H2A histone family member Y, humanhuman

TSL 3

Gene H2AFY, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY-212ENST00000508120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.33■■■■■ 6.61
H2AFY-212ENST00000508120 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.25■■■■■ 5.63
H2AFY-212ENST00000508120 ABCC9O60706 1549 aa49.71■■■■■ 5.55
H2AFY-212ENST00000508120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.55■■■■■ 5.2
H2AFY-212ENST00000508120 NACADO15069 1562 aa47.38■■■■■ 5.18
H2AFY-212ENST00000508120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.25■■■■■ 5.15
H2AFY-212ENST00000508120 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.94■■■■■ 5.1
H2AFY-212ENST00000508120 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
H2AFY-212ENST00000508120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.55■■■■■ 5.04
H2AFY-212ENST00000508120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.5■■■■■ 5.03
H2AFY-212ENST00000508120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
H2AFY-212ENST00000508120 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.19■■■■■ 4.99
H2AFY-212ENST00000508120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.16■■■■■ 4.98
H2AFY-212ENST00000508120 SCRIBQ14160 1630 aa45.85■■■■■ 4.93
H2AFY-212ENST00000508120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.59■■■■■ 4.89
H2AFY-212ENST00000508120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
H2AFY-212ENST00000508120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.93■■■■■ 4.78
H2AFY-212ENST00000508120 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
H2AFY-212ENST00000508120 SMARCA4P51532 1647 aa43.8■■■■■ 4.6
H2AFY-212ENST00000508120 NCAPD3P42695 1498 aa43.75■■■■■ 4.59
H2AFY-212ENST00000508120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.71■■■■■ 4.59
H2AFY-212ENST00000508120 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
H2AFY-212ENST00000508120 SMARCA2P51531 1590 aa43.58■■■■■ 4.57
H2AFY-212ENST00000508120 HMGXB3Q12766 1538 aa43.47■■■■■ 4.55
H2AFY-212ENST00000508120 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.41■■■■■ 4.54
H2AFY-212ENST00000508120 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.37■■■■■ 4.53
H2AFY-212ENST00000508120 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
H2AFY-212ENST00000508120 WIZO95785 1651 aa42.91■■■■■ 4.46
H2AFY-212ENST00000508120 NESP48681 1621 aa42.89■■■■■ 4.46
H2AFY-212ENST00000508120 ERCC6Q03468 1493 aa42.85■■■■■ 4.45
H2AFY-212ENST00000508120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
H2AFY-212ENST00000508120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
H2AFY-212ENST00000508120 CUX2O14529 1486 aa42.58■■■■■ 4.41
H2AFY-212ENST00000508120 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.45■■■■■ 4.39
H2AFY-212ENST00000508120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
H2AFY-212ENST00000508120 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.38■■■■■ 4.38
H2AFY-212ENST00000508120 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.32■■■■■ 4.37
H2AFY-212ENST00000508120 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
H2AFY-212ENST00000508120 CFTRP13569 1480 aa42.1■■■■■ 4.33
H2AFY-212ENST00000508120 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.99■■■■■ 4.31
H2AFY-212ENST00000508120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.96■■■■■ 4.31
H2AFY-212ENST00000508120 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.93■■■■■ 4.3
H2AFY-212ENST00000508120 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.93■■■■■ 4.3
H2AFY-212ENST00000508120 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.92■■■■■ 4.3
H2AFY-212ENST00000508120 WDR62O43379 1518 aa41.88■■■■■ 4.29
H2AFY-212ENST00000508120 PRDM2Q13029 1718 aa41.69■■■■■ 4.26
H2AFY-212ENST00000508120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
H2AFY-212ENST00000508120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
H2AFY-212ENST00000508120 TOPBP1Q92547 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
H2AFY-212ENST00000508120 ABCC8Q09428 1581 aa41.16■■■■■ 4.18
H2AFY-212ENST00000508120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.13■■■■■ 4.18
H2AFY-212ENST00000508120 IFT140Q96RY7 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
H2AFY-212ENST00000508120 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
H2AFY-212ENST00000508120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
H2AFY-212ENST00000508120 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
H2AFY-212ENST00000508120 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
H2AFY-212ENST00000508120 CUX1P39880 1505 aa40.76■■■■■ 4.12
H2AFY-212ENST00000508120 OSCARQ8IYS5 282 aa40.74■■■■■ 4.11
H2AFY-212ENST00000508120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.7■■■■■ 4.11
H2AFY-212ENST00000508120 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.69■■■■■ 4.12e-6■■■□□ 14.7
H2AFY-212ENST00000508120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.68■■■■■ 4.1
H2AFY-212ENST00000508120 SOGA1O94964 1423 aa40.67■■■■■ 4.1
H2AFY-212ENST00000508120 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
H2AFY-212ENST00000508120 WDR97A6NE52 1622 aa40.42■■■■■ 4.06
H2AFY-212ENST00000508120 CHD1O14646 1710 aa40.35■■■■■ 4.05
H2AFY-212ENST00000508120 TRIM41Q8WV44 630 aa40.3■■■■■ 4.04
H2AFY-212ENST00000508120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.28■■■■■ 4.04
H2AFY-212ENST00000508120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
H2AFY-212ENST00000508120 FBLN2P98095 1184 aa40.27■■■■■ 4.04
H2AFY-212ENST00000508120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.26■■■■■ 4.04
H2AFY-212ENST00000508120 GRIN2BQ13224 1484 aa40.25■■■■■ 4.03
H2AFY-212ENST00000508120 TOP2BQ02880 1626 aa40.24■■■■■ 4.03
H2AFY-212ENST00000508120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.24■■■■■ 4.03
H2AFY-212ENST00000508120 SYNJ1O43426 1573 aa40.23■■■■■ 4.03
H2AFY-212ENST00000508120 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.19■■■■■ 4.02
H2AFY-212ENST00000508120 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
H2AFY-212ENST00000508120 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.16■■■■■ 4.02
H2AFY-212ENST00000508120 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.16■■■■■ 4.02
H2AFY-212ENST00000508120 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.16■■■■■ 4.02
H2AFY-212ENST00000508120 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.14■■■■■ 4.02
H2AFY-212ENST00000508120 PBRM1Q86U86 1689 aa40.11■■■■■ 4.01
H2AFY-212ENST00000508120 ARHGEF11O15085 1522 aa40.1■■■■■ 4.01
H2AFY-212ENST00000508120 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
H2AFY-212ENST00000508120 SYNJ2O15056 1496 aa40.05■■■■■ 4
H2AFY-212ENST00000508120 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.92■■■■□ 3.98
H2AFY-212ENST00000508120 ADAMTS12P58397 1594 aa39.8■■■■□ 3.96
H2AFY-212ENST00000508120 ARAP1Q96P48 1450 aa39.76■■■■□ 3.96
H2AFY-212ENST00000508120 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.76■■■■□ 3.96
H2AFY-212ENST00000508120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.75■■■■□ 3.95
H2AFY-212ENST00000508120 GRIN2AQ12879 1464 aa39.74■■■■□ 3.95
H2AFY-212ENST00000508120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.71■■■■□ 3.95
H2AFY-212ENST00000508120 NUP160Q12769 1436 aa39.6■■■■□ 3.93
H2AFY-212ENST00000508120 CEP170Q5SW79 1584 aa39.58■■■■□ 3.93
H2AFY-212ENST00000508120 KIF27Q86VH2 1401 aa39.47■■■■□ 3.91
H2AFY-212ENST00000508120 IGF1RP08069 1367 aa39.42■■■■□ 3.9
H2AFY-212ENST00000508120 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.36■■■■□ 3.89
H2AFY-212ENST00000508120 SHROOM2Q13796 1616 aa39.34■■■■□ 3.89
H2AFY-212ENST00000508120 CUL7Q14999 1698 aa39.27■■■■□ 3.88
H2AFY-212ENST00000508120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.22■■■■□ 3.87
H2AFY-212ENST00000508120 JPH4Q96JJ6 628 aa39.19■■■■□ 3.86
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